La pratica di Jala Neti aiuta a prevenire e ad eliminare sinusiti e mal di testa. Aiuta a mantenere un buon funzionamento dei meccanismi di drenaggio e di secrezione dell'orecchio, del naso e della gola. Aiuta a tenere lontano raffreddori, tosse, catarro, febbre da fieno e tonsilliti. Inoltre Jala Neti rafforza gli occhi, per via della stimolazione sanguigna attivata nell'area oculare e nasale. Esercita un effetto rilassante e irrigante sugli occhi mediante la stimolazione dei dotti e delle ghiandole lacrimali.
Ad un livello emotivo, la pratica del Jala Neti rilascia tensioni ed è efficace nei casi di depressione, ansietà ed isteria.